Чтобы оно заработало нужно подвеситься на нужные вам события и соответственно написать код нужных вам действий. Если есть сложности, вы можете написать заявку в нашу платную поддержку, опишите как вы хотели бы, чтобы это работало, наши специалисты сделают.

2. Возможна ли автоматическая привязка менеджера заказа, в зависимости от филиала или от того с какого из партнерского сайта поступил заказ, заказ в 1 клик.

Возможно с помощью соответствующей доработки. Нужно писать отдельный модуль, вешаться на событие создания данных объектов, присваивать нужного менеджера в зависимости от ситуации.

0. Создаем кастомный модуль
1. Подвешиваемся на событие  meter.recalculate , чтобы ваш обработчик выполнился последним:

class Handlers extends \RS\Event\HandlerAbstract
{
    function init()
    {
        $this->bind('meter.recalculate', null, null, 0); //Ставим приоритет - 0
    }
}

2. Удаляем из массива нужные элементы:

//...
use Shop\Model\OrderApi;
//...
class Handlers extends \RS\Event\HandlerAbstract
{
    function init()
    {
        $this->bind('meter.recalculate', null, null, 0); //Ставим приоритет - 0
    }

    public static function meterRecalculate($meters)
    {
        unset($meters[OrderApi::METER_ORDER]);
        return $meters;
    }
}

2. Возможна ли автоматическая привязка менеджера заказа, в зависимости от филиала или от того с какого из партнерского сайта поступил заказ, заказ в 1 клик.

Кто может поделиться своими соображениями)