Сергей, вы очень легко можете убедиться в том добавлен ли код счетчика или нет на сайте.
Просто посмотрите на исходный код страницы. Если пользуйтесь Firefox'ом, то CTRL+U. И поищите отрывок вашего кода.

Все хорошо, оказывается гугл не сразу "видит" свой скрипт, а через пару дней

Возможно вы забыли очистить кэш после правки шаблона. Иконка со стрелкой в шапке админ. панели. Попробуйте, пожалуйста.

Да, я знаю что нужно обновить кэш

Вот что добавлено в шаблоне:

И все равно, гугл не видит

Должно пройти какое-то время, перед тем, как гугл увидит скрипт?

Перейдите в раздел административной панели Управление → Шаблоны. Убедитесь, что ниже надписи "Редактор шаблонов" выбрана корневая папка необходимой темы оформления. Откройте к редактированию файл layout.tpl. В конец файла вставьте код счетчика и оберните его конструкцией {literal}...{/literal}

{literal} ЗДЕСЬ КОД ОДНОГО ИЛИ НЕСКОЛЬКИХ СЧЕТЧИКОВ {/literal}