Замена кода движка и обновление сайта

Здравствуйте.
Был изменен код сайбара в файле modules\catalog\view\blocks\category\category.tpl, чтобы дочерние категории выводились таблицей. После обновления версии изменился файл новым кодом на тот же файл со старым кодом. Как происходит обновление? Все удаляется и файлы записываются заново или просто затираются старые файлы? Т.е. если я создам файл с названием, которого у вас нет, он удалится при обновлении? Или может подскажете другой вариант, как избежать подобного, помимо после каждого обновления перезаписывать файл modules\catalog\view\blocks\category\category.tpl?