Меню с запоминанием положения

Не совсем понятно, что Вы хотите сделать... Если можно распишите поподробнее.

Вообще блок с выводом категорий строит древовидную структуру исходя из указанного Вами корневого элемента. Предполагается, что он не не нужен, т.к. будет всего один. Поэтому на прямую корневой элемент в сам шаблон и не поступает.
Просто в меню категорий как-то странновато, выводит один единственный элемент.
Ну в принципе получить корневой элемент можно из параметров самого блока. Например:

{* Подгружаем элемент категории из базы *}
{static_call var=root_dir callback=['\Catalog\Model\Orm\Dir', 'loadByWhere'] params=[['id'=>$this_controller->getParam('root')]]}
{* Покажем сам корневой элемент *}
<pre>
{var_dump($root_dir)}
</pre>

Если речь идет о блоке \Catalog\Controller\Block\Category, т.е. о шаблоне category.tpl, то внутри шаблона у вас всегда доступна $pathids, в которой содержится массив из ID текущего элемента и всех его родителей.

Соответственно, проверяя с помощью in_array(), находится ли ID категории в списке $pathids - вы можете узнать активна ли она сейчас.

           {foreach from=$dirlist item=dir}
            <li {if in_array($dir.fields.id, $pathids)}class="act"{/if}>{$dir.fields.name}
                <ul>
                    {foreach from=$dir.child item=item}
                    <li {if in_array($item.fields.id, $pathids)}class="act"{/if}>{$item.fields.name}</li>
                    {/foreach}
                </ul>
                {/if}
            </li>
            {/foreach}

А дальше уже с помощью CSS, реализовывайте любое отображение