Альтернативную конфигурацию можно задавать в файле _local_settings.php, который вы можете держать на локальной машине в корне вашего сайта и не выгружать на production. В _local_settings.php можно перегрузить все свойства \Setup, (как известно /config.auto.php лишь инициализирует значения статических свойств класса \Setup)
Пример _local_settings.php:
<?php
\Setup::DB_HOST = 'localhost';
\Setup::DB_NAME = 'dbname';
\Setup::DB_USER = 'dbuser';
\Setup::DB_PASS = 'dbpass';
\Setup::DB_TABLE_PREFIX = 'dbprefix';
//Всегда отображать исключения
//\Setup::$DETAILED_EXCEPTION = true;
//Всегда проверять шаблон на предмет модификации
//\Setup::$SM_COMPILE_CHECK = true;
//Всегда отключенный кэш
//\Setup::$CACHE_ENABLED = false;
Полный список всех свойств, доступных к настройке можно найти в классе \RS\Config\AbstractSetup